論文

• Daiki Nakatsu, Rina Kunishige, Yuki Taguchi, Naeko Shinozaki-Narikawa, Kishiko Osaka, Kayo Yokomizo, Mami Ishida, Shunsuke Takei, Shoko Yamasaki, Keita Hagiya, Kotaro Hattori, Tadashi Tsukamoto, Masayuki Murata, Fumi Kano. BMP4-SMAD1/5/9-RUNX2 pathway activation inhibits neurogenesis and oligodendrogenesis in Alzheimer’s patients’ iPSCs in senescence-related conditions, Stem Cell Reports, Vol. 18, Page 1-18, Feb. 2023.
• Rina Kunishige, Masayuki Murata, Fumi Kano. Targeted protein degradation by Trim-Away using cell resealing coupled with microscopic image-based quantitative analysis, Frontiers in Cell and Developmental Biology, Vol. 10, Dec. 2022.  公式リンク  
  
• Yoshiyuki Noguchi, Fumi Kano, Nobuhiko Maiya, Chisako Iwamoto, Shoko Yamasaki, Yosuke Otsubo, Daiki Nakatsu, Rina Kunishige, Masayuki Murata. Microscopic image-based covariation network analysis for actin scaffold-modified insulin signaling, iScience, pp. 102724, July 2021.  公式リンク  
  
• Kazuhiro Shiizaki, Asako Tsubouchi, Yutaka Miura, Kinya Seo, Takahiro Kuchimaru, Hirosaka Hayashi, Yoshitaka Iwazu, Marina Miura, Batpurev Battulga, Nobuhiko Ohno, Toru Hara, Rina Kunishige, Mamiko Masutani, Keita Negishi, Kazuomi Kario, Kazuhiko Kotani, Toshiyuki Yamada, Daisuke Nagata, Issei Komuro, Hiroshi Itoh, Hiroshi Kurosu, Masayuki Murata, Makoto Kuro-o. Calcium phosphate microcrystals in the renal tubular fluid accelerate chronic kidney disease progression, The Journal of Clinical Investigation, June 2021.  公式リンク  
  
• Sonoda, Y., Kano, F., Murata, M.. Applications of cell resealing to reconstitute microRNA loading to extracellular vesicles, Scientific Reports, Feb. 2021.
• Rina Kunishige, Mai Mizoguchi, Asako Tsubouchi, Kenjiro Hanaoka, Yutaka Miura, Hiroshi Kurosu, Yasuteru Urano, Makoto Kuro-o, Masayuki Murata. Calciprotein particle-induced cytotoxicity via lysosomal dysfunction and altered cholesterol distribution in renal epithelial HK-2 cells, Scientific Reports, Vol. 10, No. 1, Dec. 2020.  公式リンク  
  
• RinaKunishige, Fumi Kano, Masayuki Murata. The cell resealing technique for manipulating, visualizing, and elucidating molecular functions in living cells, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, Vol. 1864, No. 2, pp. 129329, Feb. 2020.  公式リンク  
  
• Daiki Nakatsu, Fumi Kano, Naeko Shinozaki-Narikawa, Masayuki Murata. Pyk2-dependent phosphorylation of LSR enhances localization of LSR and tricellulin at tricellular tight junctions, PLOS ONE, Vol. 14, No. 10, pp. e0223300, Oct. 2019.
• Fumi Kano, Masayuki Murata. Phosphatidylinositol-3-phosphate-mediated actin domain formation linked to DNA synthesis upon insulin treatment in rat hepatoma-derived H4IIEC3 cells., Biochim. Biophys. Acta (BBA) – Mol. Cell Res, Vol. 1866, No. 5, pp. 793-805, May 2019.
• Fumihiko Ogasawara, Fumi Kano, Masayuki Murata, Yasuhisa Kimura, Noriyuki Kioka, Kazumitsu Ueda. Changes in the asymmetric distribution of cholesterol in the plasma membrane influence streptolysin O pore formation, Sci. Rep., Vol. 9, 4548, Mar. 2019.
• Miho Watanabe-Takahashi, Shinji Yamasaki, Masayuki Murata, Fumi Kano, Jun Motoyama, Jyoji Yamate, Jumpei Omi, Waka Sato, Hirofumi Ukai, Kentaro Shimasaki, Masaya Ikegawa, Miwa Tamura-Nakano, Ryohei Yanoshita, Yuri Nishino, Atsuo Miyazawa, Yasuhiro Natori, Noriko Toyama-Sorimachi, Kiyotaka Nishikawa. Exosome-associated Shiga toxin 2 is released from cells and causes severe toxicity in mice, Scientific Reports, Vol. 8, No. 1, Page 10776, July 2018.
• 國重 莉奈, 加納 ふみ, 村田 昌之. 特集 生体膜のバイオロジー Ⅴ.新技術 セミインタクト細胞リシール技術を用いた細胞機能解析, 生体の科学, June 2018.  公式リンク  
  
• Masataka Murakami, Fumi Kano, Masayuki Murata. LLO-mediated Cell Resealing System for Analyzing Intracellular Activity of Membrane-impermeable Biopharmaceuticals of Mid-sized Molecular Weight, Scientific Reports, Vol. 8, No. 1, Page 1946, Jan. 2018.
• Yudai Yamaoki, Ayaka Kiyoishi, Masayuki Miyake, Fumi Kano, Masayuki Murata, Takashi Nagata, Masato Katahira. The first successful observation of in-cell NMR signals of DNA and RNA in living human cells, Physical Chemistry Chemical Physics, Vol. 20, Page 2982-2985, Jan. 2018.
• Fumi Kano, Yoshiyuki Noguchi, Masayuki Murata. Establishment and phenotyping of disease model cells created by cell-resealing technique, Scientific Reports, Vol. 7, No. 1, Page 15167, Nov. 2017.
• Yuta Horiuchi, Daiki Nakatsu, Fumi Kano, Masayuki Murata. Pyruvate kinase M1 interacts with A-Raf and inhibits endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis by activating MEK1/ERK pathway in mouse insulinoma cells., Cellular Signalling, 38, 212-222, July 2017.
• Yuki Taguchi, Yuta Horiuchi, Fumi Kano, Masayuki Murata. Novel prosurvival function of Yip1A in human cervical cancer cells: constitutive activation of the IRE1 and PERK pathways of the unfolded protein response, Cell Death and Disease, Vol. 8, No. 3, Page e2718, Mar. 2017.
• Mariko Matsuto, Fumi Kano, Masayuki Murata. Reconstitution of the targeting of Rab6A to the Golgi apparatus in semi-intact HeLa cells: A role of BICD2 in stabilizing Rab6A on Golgi membranes and a concerted role of Rab6A/BICD2 interactions in Golgi-to-ER retrograde transport, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Molecular Cell Research, Vol. 1853, No. 10 Part A, Page 2592-2609, May 2015.
• Yuki Taguchi, Koichi Imaoka, Michiyo Kataoka, Akihiko Uda, Daiki Nakatsu, Sakuya Horii-Okazaki, Rina Kunishige, Fumi Kano, Masayuki Murata. Yip1A, a Novel Host Factor for the Activation of the IRE1 Pathway of the Unfolded Protein Response during Brucella Infection, PLOS Pathogens, Vol. 11, No. 3, pp. e1004747, Mar. 2015.  公式リンク  
  
• Tamaki Arai, Fumi Kano, Masayuki Murata. Translocation of forkhead box O1 to the nuclear periphery induces histone modifications that regulate transcriptional repression of PCK1 in HepG2 cells. Genes Cells, Genes Cells, Vol. 20, No. 4, Page 340-357, Mar. 2015.
• Daiki Nakatsu, Yuta Horiuchi, Fumi Kano, Yoshiyuki Noguchi, Taichi Sugawara, Iseki Takamoto, Naoto Kubota, Takashi Kadowaki, Masayuki Murata. L-cysteine reversibly inhibits glucose-induced biphasic insulin secretion and ATP production by inactivating PKM2., Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A, PNAS, PRONAS, 112, 10, E1067-E1076, Feb. 2015.
• Taichi Sugawara, Fumi Kano, Masayuki Murata. Rab2A is a pivotal switch protein that promotes either secretion or ER-associated degradation of (pro)insulin in insulin-secreting cells, Scientific Reports, Vol. 4, Nov. 2014.
• Daiki Nakatsu, Fumi Kano, Yuki Taguchi, Taichi Sugawara, Takashi Nishizono, Kiyotaka Nishikawa, Yukako Oda, Mikio Furuse, Masayuki Murata. JNK1/2-dependent phosphorylation of angulin-1/LSR is required for the exclusive localization of angulin-1/LSR and tricellulin at tricellular contacts in EpH4 epithelial sheet., Genes to Cells, 19, 7, 565-581, June 2014.
• Katsunori Fujiki, Akihiro Shinoda, Fumi Kano, Ryuichiro Sato, Katsuhiko Shirahige, Masayuki Murata. PPARγ-induced PARylation promotes local DNA demethylation by production of 5-hydroxymethylcytosine, Nature Communications, Vol. 4, Aug. 2013.
• Kano F, Murata M. The Semi-Intact Cell System and Methods for Cell Resealing: a Novel Systems Biology Tool to Elucidate Protein Networks with Spatio-Templioral Information, Advances in Systems Biology, Vol. 2, No. 1, Page 6-14, Mar. 2013.
• Murata, M., Kano, F. Hydrogen peroxide depletes phosphatidylinositol-3-phosphate from endosomes in a p38MAPK-dependent manner and perturbs endocytic transports and signal transduction in pathogenic cells, Hydrogen peroxide : detection, applications and health implications series, Nova Science Publishers, Oct. 2012.
• Fumi Kano, Daiki Nakatsu, Yoshiyuki Noguchi, Akitsugu Yamamoto, Masayuki Murata. A resealed-cell system for analyzing pathogenic intracellular events: perturbation of endocytic pathways under diabetic conditions., PLOS ONE, 7, 8, e44127, Aug. 2012.
• Murata, M., Kano, F. Semi-Intact Cell Systems - Application to the Analysis of Membrane Trafficking Between the Endoplasmic Reticulum and the Golgi Apparatus and of Cell Cycle-Dependent Changes in the Morphology of These Organelles, Crosstalk and Integration of Membrane Trafficking Pathways, Apr. 2012.
• Taichi Sugawara, Daiki Nakatsu, Hiroaki Kii, Nobuhiko Maiya, Atsuhiro Adachi, Akitsugu Yamamoto, Fumi Kano, Masayuki Murata. PKCδ and ε regulate the morphological integrity of the ER-Golgi intermediate compartment (ERGIC) but not the anterograde and retrograde transports via the Golgi apparatus., BBA - Molecular Cell Research, 1823, 4, 861-875, Jan. 2012.
• Fumi Kano, Tamaki Arai, Mariko Matsuto, Hanako Hayashi, Moritoshi Sato, Masayuki Murata. Hydrogen peroxide depletes phosphatidylinositol-3-phosphate from endosomes in a p38 MAPK-dependent manner and perturbs endocytosis, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, Vol. 1813, No. 5, Page 784-801, May 2011.
• Atsuhiro Adachi, Fumi Kano, Takashi Tsuboi, Morihisa Fujita, Yusuke Maeda, Masayuki Murata. Golgi-associated GSK3β regulates the sorting process of post-Golgi membrane trafficking, Journal of Cell Science, Vol. 123, No. 19, Page 3215-3225, Oct. 2010.
• Miho Watanabe-Takahashi, Toshio Sato, Taeko Dohi, Noriko Noguchi, Fumi Kano, Masayuki Murata, Takashi Hamabata, Yasuhiro Natori, Kiyotaka Nishikawa. An Orally Applicable Shiga Toxin Neutralizer Functions in the Intestine To Inhibit the Intracellular Transport of the Toxin, INFECTION AND IMMUNITY, Vol. 78, No. 1, Page 177-183, Jan. 2010.
• Rei K. Morikawa, Junken Aoki, Fumi Kano, Masayuki Murata, Akitsugu Yamamoto, Masafumi Tsujimoto, Hiroyuki Arai. Intracellular Phospholipase A1γ (iPLA1γ) Is a Novel Factor Involved in Coat Protein Complex I- and Rab6-independent Retrograde Transport between the Endoplasmic Reticulum and the Golgi Complex, The journal of biological chemistry, Vol. 284, No. 39, Page 26620–26630, Sept. 2009.
• Ken Fujimura, Jun Katahira, Fumi Kano, Yoshihiro Yoneda, Masayuki Murata. Microscopic dissection of the process of stress granule assembly, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, Vol. 1793, No. 11, Page 1728-1737, Sept. 2009.
• Fumi Kano, Shinobu Yamauchi1, Yumi Yoshida, Miho Watanabe-Takahashi, Kiyotaka Nishikawa, Nobuhiro Nakamura, Masayuki Murata. Yip1A regulates the COPI-independent retrograde transport from the Golgi complex to the ER, Journal of Cell Science, Vol. 122, Page 2218-2227, Aug. 2009.
• Katsunori Fujiki, Fumi Kano, Kunio Shiota, Masayuki Murata. Expression of the peroxisome proliferator activated receptor γ gene is repressed by DNA methylation in visceral adipose tissue of mouse models of diabetes, BMC Biology, Vol. 7(1), No. 38, July 2009.
• Ken Fujimura, Jun Katahira, Fumi Kano, Yoshihiro Yoneda, Masayuki Murata. Selective localization of PCBP2 to cytoplasmic processing bodies, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, Vol. 1793, No. 5, Page 878-887, May 2009.
• Atsuhiro Adachi, Fumi Kano, Takaomi C Saido, Masayuki Murata. Visual screening and analysis for kinase-regulated membrane trafficking pathways that are involved in extensive beta-amyloid secretion, Genes to Cells, Vol. 14, Page 355-369, Feb. 2009.
• Arowu R Tanaka, Fumi Kano, Akitsugu Yamamoto, Kazumitsu Ueda, Masayuki Murata. Formation of cholesterol‐enriched structures by aberrant intracellular accumulation of ATP‐binding cassette transporter A1, Genes to Cells, Vol. 13, No. 8, Page 889-904, July 2008.
• Ken Fujimura, Fumi Kano, Masayuki Murata. Identification of PCBP2, a Facilitator of IRES-Mediated Translation, as a Novel Constituent of Stress Granule and Processing Body, RNA, Vol. 14, No. 3, Page 425-431, June 2008.
• Arowu R Tanaka, Fumi Kano, Kazumitsu Ueda, Masayuki Murata. The ABCA1 Q597R mutant undergoes trafficking from the ER upon ER stress, Biochemical and Biophysical Research Communications, Vol. 369, No. 4, Page 1174-1178, May 2008.
• Takanori Kihara, Fumi Kano, Masayuki Murata. Modulation of SRF-dependent gene expression by association of SPT16 with MKL1, Experimental Cell Research, Vol. 314, No. 3, Page 629-637, Feb. 2008.
• Ken Fujimura, Fumi Kano, Masayuki Murata. Dual localization of the RNA binding protein CUGBP-1 to stress granule and perinuceolar compartment, Experimental Cell Research, Vol. 314, No. 3, Page 543-553, Feb. 2008.
• Fumi Kano, Hisao Kondo, Akitsugu Yamamoto, Yayoi Kaneko, Keiji Uchiyama, Nobuko Hosokawa, Kazuhiro Nagata, Masayuki Murata. NSF/SNAPs and p97/p47/VCIP135 are sequentially required for cell cycle-dependent reformation of the ER network, Genes to Cells, Vol. 10, Page 989-999, Aug. 2005.
• Fumi Kano, Hisao Kondo, Akitsugu Yamamoto, Arowu R Tanaka, Nobuko Hosokawa, Kazuhiro Nagata, Masayuki Murata. The maintenance of the endoplasmic reticulum network is regulated by p47, a cofactor of p97, through phosphorylation by cdc2 kinase, Genes to Cells, Vol. 10, Page 333–344, Mar. 2005.
• Fumi Kano, Arowu R. Tanaka, Shinobu Yamauchi, Hisao Kondo, Masayuki Murata. Cdc2 Kinase-dependent Disassembly of Endoplasmic Reticulum (ER) Exit Sites Inhibits ER-to-Golgi Vesicular Transport during Mitosis, Molecular Biology of the Cell, Vol. 15, No. 9, Page 4289-4298, Sept. 2004.
• Satomi Nadanaka, Hiderou Yoshida, Fumi Kano, Masayuki Murata, Kazutoshi Mori. Activation of Mammalian Unfolded Protein Response Is Compatible with the Quality Control System Operating in the Endoplasmic Reticulum, Molecular Biology of the Cell, Vol. 15, No. 6, Page 2537-2548, June 2004.
• Junichi Yuasa‐Kawada, Ryoko Suzuki, Fumi Kano, Takeshi Ohkawara, Masayuki Murata, Masaharu Noda. Axonal morphogenesis controlled by antagonistic roles of two CRMP subtypes in microtubule organization, European Journal of Neuroscience, Vol. 17, No. 11, Page 2329-2343, June 2003.
• Keiji Uchiyama, Eija Jokitalo, Mervi Lindman, Mark Jackman, Fumi Kano, Masayuki Murata, Xiaodong Zhang, Hisao Kondo. The localization and phosphorylation of p47 are important for Golgi disassembly–assembly during the cell cycle, The Journal of Cell Biology, Vol. 161, No. 6, Page 1067-1079, June 2003.
• Arowu R. Tanaka, Sumiko Abe-Dohmae, Tomohiro Ohnishi, Ryo Aoki, Gaku Morinaga, Kei-ichiro Okuhira, Yuika Ikeda, Fumi Kano, Michinori Matsuo, Noriyuki Kioka, Teruo Amachi, Masayuki Murata, Shinji Yokoyama, Kazumitsu Ueda. Effects of Mutations of ABCA1 in the First Extracellular Domain on Subcellular Trafficking and ATP Binding/Hydrolysis, The journal of biological chemistry, Vol. 278, No. 10, Page 8815–8819, Mar. 2003.
• Keiji Uchiyama, Eija Jokitalo, Fumi Kano, Masayuki Murata, Xiaodong Zhang, Benito Canas, Richard Newman, Catherine Rabouille, Darryl Pappin, Paul Freemont, Hisao Kondo. VCIP135, a novel essential factor for p97/p47-mediated membrane fusion, is required for Golgi and ER assembly in vivo, Journal of Cell Biology, 159, 5, 855-866, Dec. 2002.
• Fumi Kano, Yasushi Sako, Mitsuo Tagaya, Toshio Yanagida, Masayuki Murata. Reconstitution of Brefeldin A–induced Golgi Tubulation and Fusion with the Endoplasmic Reticulum in Semi-Intact Chinese Hamster Ovary Cells, Molecular Biology of the Cell, Vol. 11, No. 9, 2833-3263, June 2000.
• Fumi Kano, Kuniaki Nagayama, Masayuki Murata. Reconstitution of the Golgi reassembly process in semi-intact MDCK cells, Biophysical Chemistry, Volume 84, 3, Page 261-268, May 2000.
• Fumi Kano, Katsuya Takenaka, Akitsugu Yamamoto, Kuniaki Nagayama, Eisuke Nishida, Masayuki Murata. Mek and Cdc2 Kinase Are Sequentially Required for Golgi Disassembly in Mdck Cells by the Mitotic Xenopus Extracts, Journal of Cell Biology, 149, 2, 357-368, Apr. 2000.

著書

• Fumi Kano, Masayuki Murata. Semi-intact cell system for reconstituting and analyzing cellular Golgi dynamics., The Golgi Apparatus and Centriole, Springer, Vol. 19, pp. 233-250, Aug. 2019.
• 加納ふみ, 野口誉之, 村田昌之. セミインタクト細胞リシール技術を用いた糖尿病モデル細胞アレイとその解析法, バイオテクノロジーシリーズ『臓器チップの技術と開発動向』（監修：酒井康行、金森敏幸）, シーエムシー出版, pp. 222-229, Apr. 2018.
• 村田昌之, 加納ふみ. 病態モデル細胞の創成と新展開 ー未来のナノメディシンに資する新しい細胞編集技術−, キヤノン財団ライブラリー『ナノテクノロジーが拓く未来の医療』（片岡一則編著）, 丸善プラネット, pp. 228-249, Dec. 2017.
• Fumi Kano, Katsuya Takenaka, Masayuki Murata. Reconstitution of Golgi disassembly by mitotic Xenopus egg extracts in semi-intact MDCK cells, Xenopus protocol; methods in molecular biology (X. Johne Liu ed.), Humana Press, pp. 357-365, 2006.
• 村田昌之, 加納ふみ. 細胞内小胞輸送ネットワークにおけるゴルジ体のダイナミクス, シリーズ・ニューバイオフィジクスII 4巻『生体膜のダイナミクス』（八田一郎、村田昌之編）, 共立出版, pp. 119-138, 2000.

国際会議発表 (査読なし・不明)

• Fumi Kano, Yoshiyuki Noguchi, Daiki Nakatsu, Masayuki Murata. Microscopic image-based technologies for analyzing spatiotemporal regulation of protein functions, Joint International Symposium on AMED-CREST - Homeostasis & Adaptation/Repair, Jan. 2020.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 中津大貴, 角田貴史, 村田昌之, 加納ふみ. M型ピルビン酸産生酵素PKM1はトリセルラータイトジャンクション形成を介して癌化上皮細胞の浸潤を抑制する, 第76回日本細胞生物学会大会, July 2024.
• 中津 大貴, 角田貴史, 村田 昌之, 加納 ふみ. PKM1はWIP1依存的なSMAD4不活性化によるPYK2発現促進を介してトリセルラータイトジャンクションへのLSRとtricellulinの局在化と上皮細胞シートのバリア機能を調節する, 第46回日本分子生物学会年会, Dec. 2023.
• 中津大貴, 國重莉奈, 田口由起, 成川 - 篠崎‌苗子, 大坂企志子, 横溝佳代, 石田真美, 武居俊輔, 山﨑聖子, 萩屋啓太, 服部功太郎, 塚本忠, 村田昌之, 加納ふみ. 患者由来 iPS 細胞を用いたアルツハイマー依存的神経新生不全モデルの構築と構築モデル を用いた神経新生不全回復薬の同定, 第75回日本細胞生物学会大会, June 2023.
• 國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ. 薬剤に対する細胞応答を超早期に捉える新規タンパク質ネットワーク解析法, 第50回日本毒性学会学術年会, June 2023.
• 角田貴史, 中津大貴, 村田昌之, 加納ふみ. PKM1はSMAD4不活性化によるPYK2発現促進を介してトリセルラータイトジャンクションへ構成タンパク質を局在化させる, 第75回日本細胞生物学会大会, June 2023.
• 國重 莉奈, 村田 昌之, 加納 ふみ. リシール細胞技術によるTrim-Away標的タンパク質分解と解析系の構築, ⽇本ケミカルバイオロジー学会 第17回年会, May 2023.
• 國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ. シグナル伝達系タンパク質の時空間ダイナミクスを捉える新規ネットワーク解析法の開発と薬効評 価への応用, 第147回日本薬理学会関東部会, Mar. 2023.
• 國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ. 「細胞状態」の時空間的変化を活写する共変動ネットワーク解析法による薬効評価, 第96回日本薬理学会年会, Dec. 2022.
• 國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ. インスリン刺激により一過性に形成されるアクチンドメインはグリコーゲン合成の開始場となる: 細胞状態を活写する新規ネットワーク解析法の応用例, 第95回日本生化学会大会, Nov. 2022.
• 米谷 信彦, 野口 誉之, 加納 ふみ, 岩本 智沙子, 山﨑 聖子, 大坪 洋介, 中津 大貴, 國重 莉奈, 村田 昌之. 蛋白質の細胞内局在情報を活用したシグナル伝達系分析手法の開発, 第49回日本毒性学会学術年会, July 2022.
• 野口 誉之, 國重 莉奈, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ. PLOM-CON 解析: 細胞形態およびタンパク質の修飾状態を考慮した細胞内状態の時系列変化の新規推定法, 第74回日本細胞生物学会大会, June 2022.
• 國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ. インスリン刺激により一過性に形成される シグナリング「ハブ」としてのアクチンドメイン: PLOM-CON解析法を用いた新機能の予測と解明, 第74回日本細胞生物学会大会, June 2022.
• 野口 誉之, 加納 ふみ, 米谷 信彦, 岩本 智沙子, 山崎 聖子, 大坪 洋介, 中津 大貴, 國重 莉奈, 村田 昌之. 蛋白質の細胞内局在情報を活用したシグナル伝達系分析手法の開発, 日本薬学会第142年会, Mar. 2022.
• 中津大貴, 成川 - 篠崎‌苗子, 村田昌之, 加納‌ふみ. PYK2はバイセルラータイトジャンクションへのトリセルラータイトジャンクション構成タン パク質の拡散を抑制する, 第73回日本細胞生物学会大会, July 2021.
• 中津大貴, 成川 - 篠崎‌苗子, 村田昌之, 加納‌ふみ. PYK2はLSRのリン酸化亢進を介してトリセルラータイトジャンクションへのLSRとTricellulinの局在化を促進する, 第72回日本細胞生物学会大会, June 2020.
• 2) 山置 佑大, 永田 崇, 阪本 知樹, 高見 昇平, 加納 ふみ, 村田 昌之, 片平 正. In-cell NMR法によるヒト生細胞内の核酸の構造およびダイナミクスの解析, 第42回日本分子生物学会年会, Dec. 2019.
• 高見 昇平, 山置 佑大, 加納 ふみ, 村田 昌之, 坂本 泰一, 原田 和雄, 永田 崇, 片平 正人. In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸‐リガンド相互作用の解析, 第42回日本分子生物学会年会, Dec. 2019.
• 阪本 知樹, 山置 佑大, 加納 ふみ, 村田 昌之, 永田 崇, 片平 正人. ヒト生細胞内における核酸の非標準構造および構造安定性のin-cell NMR法を用いた解析, 第42回日本分子生物学会年会, Dec. 2019.
• 山置佑大, 永田崇, 清石彩華, 三宅雅之, 加納ふみ, 村田昌之, 片平正人. In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内核酸の構造およびダイナミクスの評価, 第57回日本生物物理学会年会, Sept. 2019.
• 山置佑大, 永田崇, 清石彩華, 三宅雅之, Lin Kuan-Heng, 高見昇平, 加納ふみ, 村田昌之. In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内の核酸の構造と安定性の評価, 第21回日本RNA学会年会, July 2019.
• 國重莉奈, 園田雄輝, 村上真隆, 加納ふみ, 村田昌之. セミインタクト細胞リシール技術を用いた細胞機能解析・評価系の開発, 日本ケミカルバイオロジー学会第１４回年会, June 2019.
• 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ. M型ピルビン酸産生酵素PKM1の減少は小胞体ストレス依存的な膵臓β細胞死を促進する, 第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会, June 2019.
• 山置佑大, 永田崇, 清石彩華, 三宅雅之, Lin Kuan-Heng, 高見昇平, 加納ふみ, 村田昌之, 片平正人. In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内の核酸の解析, 第41回日本分子生物学会, Nov. 2018.
• 中津 大貴, 堀内 雄太, 加納 ふみ, 村田 昌之. M型ピルビン酸産生酵素PKM1は膵臓β細胞の小胞体ストレス依存的な細胞死を抑制する, 2017年度生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017.
• 中津 大貴, 村田 昌之. 細胞外システインの増加が膵臓β細胞のインスリン分泌不全を引き起こす, 第71回日本栄養・食糧学会大会, May 2017.
• 村田昌之, 加納ふみ. 「セミインタクト細胞リシール法による病態モデル細胞構築」, 「細胞を創る」研究会9.0 セッション「細胞をデザインする」, Nov. 2016.
• 中津 大貴, 堀内 雄太, 加納 ふみ, 野口 誉之, 菅原 太一, 高本 偉碩, 窪田 直人, 門脇 孝, 村田 昌之. L-システインによるPKM2タンパク質不活性化を介した可逆的なインスリン分泌抑制：制御機構の生化学的解析, 第67回 日本細胞生物学会, July 2015.

その他の論文・著書など

• 村田昌之, 加納ふみ. リシール細胞技術を用いた“細胞編集”, 医学のあゆみ, Vol. 275, No. 1, pp. 144-148, Oct. 2020.
• 村田昌之, 加納ふみ. セミインタクト細胞リシール技術の新展開：「再構成」から「細胞編集」まで, 生化学, Vol. 90, No. 4, pp. 433-443, Aug. 2018.
• 國重莉奈, 加納ふみ, 村田昌之. セミインタクト細胞リシール技術を用いた細胞機能解析, 生体の科学, Vol. 69, No. 3, pp. 247-251, June 2018.
• 田口由起, 加納ふみ, 村田昌之. ブルセラ・アボルタス菌の細胞内増殖を制御する新規宿主因子Yip1A, 生化学, Vol. 88, No. 1, pp. 139-143, Feb. 2016.
• 加納ふみ, 村田昌之. 細胞内生命現象の再構成：病態モデル細胞構築への応用, 生体の科学, Vol. 65, No. 5, pp. 494-495, Oct. 2014.
• 加納ふみ, 村田昌之. 細胞内生命現象の再構成：病態モデル細胞構築への応用, 生体の科学, Vol. 65, No. 5, pp. 494-495, Oct. 2014.
• 村田昌之, 野口誉之, 堀内雄太, 堀井咲耶, 加納ふみ. セミインタクト細胞リシール法を用いた細胞内イベントの可視化解析―「一細胞生物学」の細胞側ツールとして―, 生物物理, Vol. 54, No. 4, Page 206-209, Aug. 2014.
• 加納ふみ, 堀内雄太, 野口誉之, 村田昌之. セミインタクト細胞リシール技術を用いた病態モデル細胞創成とその細胞工学的応用, 細胞工学, 秀潤社, Vol. 31, No. 12, pp. 1376-1382, Dec. 2012.
• 菅原太一, 加納ふみ, 村田昌之. 新しい機能を問われ出した小胞体-ゴルジ体中間区画 (ER-Golgi intermediate compartment: ERGIC), 生体の科学, Vol. 63, No. 5, pp. 424-425, Oct. 2012.
• 加納ふみ, 村田昌之. 哺乳動物細胞ゴルジ体の細胞周期依存的ディスアッセンブリー, 生体の科学, Vol. 63, No. 5, pp. 404-407, Oct. 2012.
• 村田昌之, 加納ふみ. セミインタクト細胞リシール法を用いた「病態モデル細胞」作製とその疾患研究への応用, 化学と生物, Vol. 50, No. 7, pp. 510-517, July 2012.
• 日原さえら, 加納ふみ, 村田昌之. 細胞染色のためのプローブ：小胞輸送ネットワーク内のオルガネラ・膜小胞, 実験がうまくいく 蛍光・発光試薬の選び方と使い方, 羊土社, pp. 90-94, Oct. 2007.
• 加納ふみ, 村田昌之. 細胞周期依存的なオルガネラ形態変化と細胞内小胞輸送のカップリング, 蛋白質・核酸・酵素, 共立出版, Vol. 52, No. 11, pp. 1344-1350, 2007.
• 加納ふみ, 安達淳博, 村田昌之. セミインタクト細胞を用いた細胞内ネットワークの可視化解析, 顕微鏡, Vol. 42, No. 2, pp. 143-145, 2007.
• 村田昌之, 木原隆典, 加納ふみ. セミインタクト細胞アッセイ, リポソーム応用の新展開 人工細胞の開発に向けて, pp. 312-318, 2005.
• 山内忍, 田中亜路, 加納ふみ, 村田昌之. セミインタクト細胞を用いた細胞内イベントの可視化解析, 生物物理, Vol. 45, pp. 153-156, 2005.
• 田中亜路, 山内忍, 加納ふみ, 村田昌之. セミインタクト細胞を用いた細胞内タンパク質の動態・機能の解析技術の開発, BIOINDUSTRY, シーエムシー出版, Vol. 21, No. 6, pp. 28-35, 2004.
• 加納ふみ, 村田昌之. セミインタクト細胞アッセイ系の構築, 実験医学, 羊土社, Vol. 22, No. 16, pp. 2307-2311, 2004.
• 加納ふみ, 村田昌之. GFP可視化技術を用いたオルガネラ動態観察, 実験医学別冊「培養細胞実験ハンドブック」（黒木敏雄，許南浩 編）, 羊土社, pp. 120-123, 2004.
• 村田昌之, 加納ふみ. 細胞分裂時におけるオルガネラの分配則, 実験医学, 羊土社, Vol. 21, No. 18, pp. 2580-2581, 2003.
• 加納ふみ, 田中亜路, 村田昌之. 細胞内小胞輸送ネットワークの可視化解析, 実験医学, 羊土社, Vol. 20, No. 7, pp. 961-967, 2002.
• 田中亜路, 加納ふみ, 村田昌之. 哺乳動物細胞オルガネラの細胞周期依存的ダイナミクス, 生物物理, Vol. 241, pp. 116-121, 2002.
• 加納ふみ, 田中亜路, 村田昌之. セミインタクト細胞を用いたタンパク質の細胞内ターゲティングとオルガネラバイオジェネシスの研究, ポストゲノム時代の実験講座シリーズ GFPとバイオイメージング 蛍光タンパク質の発現と検出の基本から生体機能の可視化まで, 羊土社, pp. 961-967, Oct. 2000.
• 村田昌之, 加納ふみ. セミインタクト細胞とGFPを用いたメンブレントラフィックの研究, 実験医学別冊「GFPとバイオイメージング」（宮脇敦史編）, 羊土社, pp. 259-265, 2000.
• 加納ふみ, 村田昌之. 膜の動きを観て、操作する, 細胞工学, 秀潤社, Vol. 19, No. 7, pp. 1023-1029, 2000.

特許など

• 加納ふみ, 村田昌之, 國重莉奈, 野口　誉之　. 解析システム、解析装置、解析プログラム、及び解析方法. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学, 国立大学法人東京大学. 2023/07/12. PCT/JP2023/025772. 2024/01/18. WO 2024/014489. 2024.
• 加納ふみ, 村田昌之, 國重莉奈, 野口　誉之. リシール細胞セット及びその製造方法. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学, 国立大学法人東京大学. 2022/10/14. 特願2022-165180. 2024/04/26. 特開2024-058679. 2024.
• 加納ふみ, 中津大貴, 村田昌之. アルツハイマー疾患モデル神経細胞及びその製造方法、並びにその神経細胞を用いたアルツハイマー病作用薬物のスクリーニング方法. 特許. 登録. 国立大学法人東京工業大学. 2019/05/08. 特願2019-088602. 2020/11/12. 特開2020-182423. 特許第7333579号. 2023/08/17 2023.
• 加納ふみ, 村田昌之, 園田　雄輝. エクソソームの製造方法及びその製造方法によって得られるエクソソーム. 特許. 登録. 国立大学法人東京工業大学. 2018/01/17. 特願2018-005638. 2019/07/25. 特開2019-122309. 特許第6448826号. 2018/12/14 2018.
• 村田昌之, 加納ふみ, 村上　真隆. Ｃａｓ９－ｇＲＮＡ複合体の細胞核内への導入方法、及び細胞内における標的遺伝子の改変方法. 特許. 登録. 国立大学法人東京工業大学. 2017/01/27. 特願2017-563846. 2017/08/03. 再表2017/131150. 特許第6867689号. 2021/04/13 2021.

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