論文

• Hayashi T, Matsuzaki Y, Yanagisawa K, Ohue M, Akiyama Y.. MEGADOCK-Web: an integrated database of high-throughput structure-based protein-protein interaction predictions, BMC Bioinformatics (In Proc. APBC2018), 19, (Suppl 4), 62, May 2018.  公式リンク  
  

国際会議発表 (査読なし・不明)

• Masahito Ohue, Takanori Hayashi, Yuri Matsuzaki, Keisuke Yanagisawa, Yutaka Akiyama. Megadock-Web: An Integrated Database of High-Throughput Structure-Based Protein-Protein Interaction Predictions, Biophysical Society 63rd Annual Meeting, Mar. 2019.  公式リンク  
  
• Masahito Ohue, Takanori Hayashi, Hiroki Watanabe, Yuri Matsuzaki, Nobuyuki Uchikoga, Yutaka Akiyama. Supercomputing-based exhaustive protein-protein interaction prediction and its open database., The 56th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Sept. 2018.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 林 孝紀, 大上 雅史, 秋山 泰.. 代表タンパク質構造群との構造アラインメントスコアプロファイルに基づくタンパク質間相互作用予測の高速化, 情報処理学会研究報告 バイオ情報学（BIO）, 研究報告バイオ情報学（BIO）, 情報処理学会, Vol. 2019-BIO-57, No. 12, pp. 1-8, Mar. 2019.  公式リンク  
  
• 渡辺紘生, 林孝紀, 大上雅史, 秋山泰. ミトコンドリアに関連したヒトタンパク質間相互作用予測データベースMEGADOCK-Web-Mitoの開発, 情報処理学会研究報告 バイオ情報学（BIO）, 研究報告バイオ情報学（BIO）, 情報処理学会, 2018-BIO-54, 46, 1-8, June 2018.  公式リンク  
  
• 林孝紀, 山本悠生, 松崎由理, 大上雅史, 秋山泰. タンパク質間相互作用予測統合データベースMEGADOCK-WEBの改良とクラウド計算環境との連携, 情報処理学会 第50回バイオ情報学研究会, 研究報告バイオ情報学（BIO）, 情報処理学会, 2017-BIO-50, 39, 1-8, June 2017.  公式リンク  
  
• Takanori Hayashi, Kazuki Nagasawa, Yuri Matsuzaki, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. MEGADOCK-WEB: a database of predicted protein-protein interactions and its web interface, Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2016 (IIBMP2016), Sept. 2016.

その他の論文・著書など

• 大上雅史, 林孝紀, 秋山泰. タンパク質間相互作用と複合体構造の予測結果を検索できるウェブサイト「MEGADOCK-Web」, 実験医学 2019年6月号, 羊土社, Vol. 37, No. 9, pp. 1469-1474, May 2019.  公式リンク  
  

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