タンパク質間相互作用予測結果データベース及び表示系の構築

長澤一輝; 松崎由理; 大上雅史; 秋山泰

論文・著書情報

タイトル

和文:	タンパク質間相互作用予測結果データベース及び表示系の構築
英文:

著者

和文:	長澤一輝, 松崎由理, 大上雅史, 秋山泰.
英文:	Kazuki Nagasawa, Yuri Matsuzaki, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama.

言語

Japanese

掲載誌/書名

和文:	研究報告バイオ情報学（BIO）
英文:	IPSJ SIG Technical Report

巻, 号, ページ

2016-BIO-45 2 1-4

出版年月

2016年3月11日

出版者

和文:	情報処理学会
英文:

会議名称

和文:	情報処理学会第45回バイオ情報学研究会
英文:

開催地

和文:	石川県
英文:

公式リンク

https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/ej/?action=pages_view_main&active_action=repository_view_main_item_detail&item_id=158080&item_no=1&page_id=13&block_id=8

アブストラクト

タンパク質間相互作用(protein-protein interaction,PPI)の網羅的な理解に向けて,我々は立体構造情報から高速にPPIを予測するソフトウェアMEGADOCKを開発してきた.このPPI予測結果の利活用には,結果をデータベースとして集約し,俯瞰的に閲覧できる表示系を構築することが必要不可欠である.そこで,本研究ではMEGADOCKによる予測PPIのデータベースとその表示系であるMEGADOCK-WEBの開発を行った.開発したデータベース及び表示系は,あらかじめ計算されたPPI予測結果の検索に加え,構築された複合体モデルの可視化や相互作用相手のパスウェイ上での可視化が可能で,PPI予測結果や未知PPIの可能性の検討に役立てられる.

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