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タイトル
和文:MEGADOCK 4.0: an ultra-high-performance protein-protein docking software for heterogeneous supercomputers 
英文:MEGADOCK 4.0: an ultra-high-performance protein-protein docking software for heterogeneous supercomputers 
著者
和文: 大上 雅史, 下田 雄大, 鈴木 脩司, 松崎 由理, 石田 貴士, 秋山 泰.  
英文: Masahito Ohue, Takehiro Shimoda, Shuji Suzuki, Yuri Matsuzaki, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama.  
言語 English 
掲載誌/書名
和文: 
英文:Bioinformatics 
巻, 号, ページ Volume 30    Issue 22    page 3281-3283
出版年月 2014年11月15日 
出版者
和文: 
英文: 
会議名称
和文:第3回生命医薬情報学連合大会 
英文:IIBMP2014 
開催地
和文:宮城県仙台市 
英文:Senadi, Miyagi 
公式リンク https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/22/3281/2391252?login=true
 
DOI https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu532
アブストラクト Summary: The application of protein–protein docking in large-scale interactome analysis is a major challenge in structural bioinformatics and requires huge computing resources. In this work, we present MEGADOCK 4.0, an FFT-based docking software that makes extensive use of recent heterogeneous supercomputers and shows powerful, scalable performance of >97% strong scaling.

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