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論文・著書情報


タイトル
和文:高速相同性解析ツールGHOSTXを用いた口腔内メタゲノム解析 
英文:Oral metagenomic analysis using high-speed homology searching tool GHOSTX 
著者
和文: 山澤 まりな, 伊澤 和輝, 大上 雅史, 石田 貴士, Kazuyuki Ishihara, 秋山 泰.  
英文: Marina Yamasawa, Kazuki Izawa, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Kazuyuki Ishihara, Yutaka Akiyama.  
言語 Japanese 
掲載誌/書名
和文:研究報告バイオ情報学（BIO） 
英文:IPSJ SIG Technical Report 
巻, 号, ページ 2017-BIO-50    41    1-7
出版年月 2017年6月16日 
出版者
和文:情報処理学会 
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会議名称
和文:情報処理学会 第50回バイオ情報学研究会 
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開催地
和文: 
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公式リンク https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/ej/?action=pages_view_main&active_action=repository_view_main_item_detail&item_id=182441&item_no=1&page_id=13&block_id=8
 
アブストラクト 本研究では，ホールゲノムショットガン法を使用した口腔内メタゲノムデータの大規模解析を行うことで歯周病に関連した細菌の存在度や分布，遺伝子の種類や頻度を調査し，その結果を歯周病のリスク予測へ応用することを目指している．はじめに口腔内メタゲノムデータに対して本研究室で開発された配列相同性検索ツールである GHOSTX を使用した配列相同性検索を行った．続いて，配列相同性検索の結果を用いて，検出される細菌の多様性を健常者と歯周病罹患者で比較した．この結果，これまでに歯周病への関連度が高いと言われていた細菌種と逆の性質を持つかもしれない 2 つの細菌種を見つけた．

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