生命情報解析分野におけるコンテナ型仮想化技術の動向と性能検証

青山健人; 大上雅史; 秋山泰

論文・著書情報

タイトル

和文:	生命情報解析分野におけるコンテナ型仮想化技術の動向と性能検証
英文:

著者

和文:	青山健人, 大上雅史, 秋山泰.
英文:	Kento Aoyama, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama.

言語

Japanese

掲載誌/書名

和文:	研究報告バイオ情報学（BIO）
英文:	IPSJ SIG Technical Report

巻, 号, ページ

2018-BIO-54 47 1-7

出版年月

2018年6月6日

出版者

和文:	情報処理学会
英文:

会議名称

和文:	情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO）
英文:

開催地

和文:	沖縄
英文:

公式リンク

https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/ej/?action=pages_view_main&active_action=repository_view_main_item_detail&item_id=189740&item_no=1&page_id=13&block_id=8

アブストラクト

軽量かつ高速なコンテナ型仮想化はアプリケーションの可搬性を担保し，研究の再現性を向上させるとして生命情報解析の研究でも普及しはじめている．本報告では，特に HPC 分野で主要なコンテナ型仮想環境として Docker，Shifter，Singularity を取り上げ，生命情報科学の研究ワークフローへの導入の実例を示す．また，各コンテナ型仮想環境でのタンパク質間相互作用予測ソフトウェア（MEGADOCK）の実行性能の検証を通して，計算律速な生命情報科学アプリケーションに適したコンテナ型仮想環境の選択を模索する．

Home

各種検索

サポート

T2R2について

関連リンク

論文・著書情報