論文

• Yuki Kimura, Nobuaki Nakamuta, Masato Nikaido. Plastic loss of motile cilia in the gills of Polypterus in response to high <scp>CO₂</scp> or terrestrial environments, Ecology and Evolution, Wiley, Vol. 13, No. 4, Apr. 2023.  公式リンク  
  
• Yuki Kimura, Masato Nikaido. Conserved Keratin Gene Clusters in Ancient Fish: an Evolutionary Seed for Terrestrial Adaptation, Genomics, Jan. 2021.  公式リンク  
  

国際会議発表 (査読有り)

• Yuki Kimura, Nikaido Masato. Unveiling the expansion of keratin genes in lungfishes: a possible link to terrestrial adaptation, Genes & Genetic Systems, 日本遺伝学会, Vol. 98, No. 5, pp. 249-257, Sept. 2023.  公式リンク  
  

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 伊藤隆晃, 西浦賀乃子, 木村優希, 中牟田信明, 長澤竜樹, 二階堂雅人. ポリプテルスの鼻管における化学感覚の研究, 日本動物学会関東支部第76回大会, Mar. 2024.
• 木村優希, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人. 水陸両生魚・ポリプテルスの陸上環境における恒常性維持機構, 日本動物学会第94回大会, Sept. 2023.
• 木村優希, 二階堂雅人. ハイギョゲノムから明らかにする水陸両生魚のケラチン遺伝子クラスタの拡大, 第3回日本遺伝学会春の分科会, Mar. 2023.
• 木村優希, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人. 肺呼吸する古代魚・ポリプテルスの陸上環境における恒常性維持機構, 日本動物学会関東支部会第24回大会, Mar. 2023.
• 伊藤隆晃, 西浦賀乃子, 木村優希, 中牟田信明, 長澤竜樹, 二階堂雅人. 魚類の鼻管に関する研究, 日本動物学会関東支部会第24回大会, Mar. 2023.
• 伊藤隆晃, 西浦賀乃子, 木村優希, 中牟田信明, 長澤竜樹, 二階堂雅人. 魚類に見られる鼻管の適応的意義と平行進化に関する研究, 日本進化学会第27回沼津大会, Aug. 2022.
• 木村優希, 二階堂雅人. ハイギョにおけるケラチン遺伝子クラスタの拡大, 第2回日本遺伝学会春の分科会, Mar. 2022.
• 木村優希, 中牟田信明, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人. 水陸両生の古代魚・ポリプテルスの陸上飼育に伴う遺伝子発現および形態の変化 －エラの繊毛と浸透圧調節に着目して－, 日本動物学会第92回大会, Sept. 2021.
• 木村優希, 中牟田信明, 神田真司, 兵頭晋, 二階堂雅人. 水陸両生魚・ポリプテルスは陸上環境でどのような変化を示すのか, 本進化学会第23回東京大会, Aug. 2021.
• Kimura, Y., Nobuaki Nakamuta, Kanda, S., Susumu Hyodo, Nikaido, M.. Changes in gene expression and morphology of amphibious fish in terrestrial environment, The 2nd AsiaEvo Conference, Aug. 2021.
• 木村優希, 二階堂雅人. 古代魚におけるケラチン遺伝子クラスタの保存と陸上適応との関連性, 日本遺伝学会第92回大会, Sept. 2020.
• 木村優希, 二階堂雅人. 古代魚において保存されたケラチン遺伝子クラスタと陸上環境適応の関連, 日本進化学会第22回大会, Sept. 2020.
• 木村優希, 二階堂雅人. 水陸両生の古代魚を用いた陸上飼育前後のエラ・腎臓の遺伝子発現の変動, 日本動物学会第91回大会, Sept. 2020.
• 木村優希, 二階堂雅人. 魚はどのように陸に上がったか？ ～水陸両適応の古代魚を用いた器官可塑性の解析～, 日本動物学会関東支部第72回大会, Mar. 2020.
• 木村優希, 二階堂雅人. 古代魚におけるケラチン遺伝子クラスタの保存と陸上適応との関連性, 第2回日本遺伝学会春季分科会, Mar. 2020.

学位論文

• 硬骨魚類の陸上適応に関する遺伝的基盤の解析,  審査の要旨,  博士(理学),  東京工業大学,  2024/03/26,   
• 硬骨魚類の陸上適応に関する遺伝的基盤の解析,  論文要旨,  博士(理学),  東京工業大学,  2024/03/26,   
• 硬骨魚類の陸上適応に関する遺伝的基盤の解析,  本文,  博士(理学),  東京工業大学,  2024/03/26,   

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