論文

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• Wada, T., Takagi, T., Yamaguchi, Y., Ferdous, A., Imai, T., Hirose, S., Sugimoto, S., Yano, K., Hartzog, G.A., Winston, F., Buratowski, S., Handa, H.. DSIF, a novel transcription elongation factor that regulates RNA polymerase II processivity, is composed of human Spt4 and Spt5 homologs., Genes Dev., Vol. 12, pp. 343-356, 1998.
• Wada, T., Takagi, T., Yamaguchi, Y., Watanabe, D., Handa, H.. Evidence that P-TEFb alleviates the negative effect of DSIF on RNA polymerase II-dependent transcription in vitro, EMBO J., Vol. 17, pp. 7395-7403, 1998.
• Yamaguchi, Y., Sawada, J., Yamada, M., Handa, H., Azuma, N.. Autoregulation of Pax6 transcriptional activation by two distinct DNA-binding subdomains of the paired domain, Genes Cells, Vol. 2, pp. 255-261, 1997.
• Wada, T., Takagi, T., Yamaguchi, Y., Kawase, H., Hiramoto, M., Ferdous, A., Takamiya, M., Lee, K.A., Hurst, H.C., Handa, H.. Copurification of casein kinase II with transcription factor ATF/E4TF3, Nucleic Acids Res., Vol. 24, pp. 876-884, 1996.

著書

• Junichi Yamamoto, Tomoko Asatsuma-Okumura, Takumi Ito, Yuki Yamaguchi, Hiroshi Handa. History of IMiDs and Protein Degradation as a Pharmacological Modality, Protein Homeostasis in Drug Discovery: A Chemical Biology Perspective, John Wiley & Sons, Nov. 2022.
• 山口 雄輝. 転写反応の生化学, 生体の科学, vol. 68, no. 3, p. 233-236, July 2017.
• 田村隆明, 浦聖恵, 山口雄輝. 遺伝子発現制御機構 クロマチン，転写制御，エピジェネティクス, 遺伝子発現制御機構 クロマチン，転写制御，エピジェネティクス, 東京化学同人, Apr. 2017.
• Kyota Ko, Simon Gillett, 近藤 科江, 山口 雄輝. 理系英会話アクティブラーニング1 テツヤ、国際学会いってらっしゃい, 羊土社, Nov. 2014.
• Kyota Ko, Simon Gillett, 近藤 科江, 山口 雄輝. 理系英会話アクティブラーニング2 テツヤ、ディスカッションしようか, 羊土社, Nov. 2014.
• 山口雄輝, 成田央. 基礎からしっかり学ぶ生化学, 羊土社, Oct. 2014.
• 半田宏, 山口雄輝. 新しい遺伝子工学 新版, 朝倉書店, Sept. 2014.
• 山口雄輝, 半田宏. 転写制御とエピジェネティクス—ゲノムデコードに向けて, 南山堂, Dec. 2008.
• 山口雄輝, 半田宏, 和田忠士. 転写因子による生命現象解明の最前線：実験医学増刊 25, シュプリンガー・フェアラーク, June 2007.
• Handa, Y., Yamaguchi, Y.. Hepatitis Delta Virus, Landes Bioscience / Springer Science+Business Media, 2006.
• 山口雄輝. ケミカルバイオロジー・ケミカルゲノミクス, シュプリンガー・フェアラーク, Nov. 2005.
• 山口雄輝. 転写研究集中マスター, 羊土社, Sept. 2005.
• 山口雄輝. 科学英語論文の赤ペン添削講座, Mar. 2005.
• 山口雄輝. キーワードで理解する転写イラストマップ, 羊土社, 羊土社, 2004.
• 山口雄輝. わかる実験医学シリーズ 転写がわかる, 羊土社, 羊土社, 2002.
• 山口雄輝. ゲノムからの情報発現 転写因子とその機能, シュプリンガー・フェアラーク, シュプリンガー・フェアラーク, 2000.
• 山口雄輝. BioScience用語ライブラリー新版, Sept. 1999.
• Handa, H., Yamaguchi, Y., Wada, T.. Purification of DNA binding proteins. in High resolution chromatography: A practical approach, Oxford University Press, Oxford University Press, pp. 283-302, 1999.
• 山口雄輝. BioScience用語ライブラリー, 羊土社, Sept. 1995.

国内会議発表 (査読有り)

• Yuki Yamaguchi. Comprehensive identification of proximal proteins by in situ biotinylation through a specific antibody: toward proteomic analysis of liquid droplets, 第９２回日本生化学会大会, Sept. 2019.
• Shinnnosuke Kunimi, Yuma Ito, Yuki Yamaguchi, Kumiko Sakata-Sogawa, Makio Tokunaga. Quantitative image analysis of dynamics of promoter-proximal pausing related proteins, The 54th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Nov. 2016.

国際会議発表 (査読なし・不明)

• Shunpei Tateno, Ari Zukeran, Junichi Yamamoto, Yuki Yamaguchi. Molecular mechanisms for polyadenylation site selection by NELF and related factors, Mechanisms of Eukaryotic Transcription 2017, Aug. 2017.
• Hidefumi Suzuki, Ryo Maeda, Hiroshi Kimura, Kiyoe Ura, Taka-aki Tamura, Yuki Yamaguchi. Transcription silencing by TLP contributes to etoposide-induced apoptosis, Mechanisms of Eukaryotic Transcription 2017, Aug. 2017.
• Satoshi Sakamoto, Yuki Yamaguchi, Takumi Ito, Hiroshi Handa. Elucidation of the molecular mechanisms of action of bioactive natural products using high performance affinity beads, PACIFCHEM2015, Dec. 2015.
• Satoshi Sakamoto, Takumi Ito, Yuki Yamaguchi, Hideki Ando, Hiroshi Handa. Biochemical analyses of CRBN, the target protein for immunomodulatory drugs (IMiDs), PACIFCHEM2015, Dec. 2015.
• Yuki Yamaguchi, Junichi Yamamoto. Regulatory Mechanisms for Pol II Termination Sites and 3' Processing Pathways in Higher Eukaryotes, MECHANISM OF EUKARYOTIC TRANSCRIPTION, Aug. 2015.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• Nutchaya Muksombat, Yuki Yamaguchi. A focused study of uncharacterized human genes containing putative nucleic acid-interacting motifs: toward a comprehensive understanding of the human genome, 第46回日本分子生物学会, Dec. 2023.
• 荒川 翼, 山口 雄輝, 坂本 聡. 神経変性疾患の原因であるタンパク質凝集体を選択的に分解誘導するPROTACの開発を目指した研究, 第46回日本分子生物学会, Dec. 2023.
• 原口大和, 坂本聡, 山口雄輝. 二次元的スクリーニング解析を駆使した既存抗がん剤の新規作用機序の解明を目指した研究, 第45回日本分子生物学会, Dec. 2022.
• 奥田昌彦, 諏訪哲史, 鈴木秀文, 山口雄輝, 西村善文. ヒトRNAポリメラーゼと基本転写/修復因子TFIIHの新たな相互作用の構造生物学的研究, 第45回日本分子生物学会, Dec. 2022.
• 山本淳一, 山口雄輝, 半田宏. レナリドマイド耐性多発性骨髄腫細胞の生存に重要なポマリドマイド依存性CRL4CRBNのネオ基質ARID2の解析, 第45回日本分子生物学会, Dec. 2022.
• 高橋秀尚, 鈴木秀文, 阿部竜太, 嶋田美穂, 廣瀬智威, 廣瀬博子, 野口慶介, 池陽子, 安井七海, 古郡華月, 山口雄輝, 豊田敦, 鈴木穣, 山本達郎, 斉藤典子, Sato Shigeo, Tomomori-Sato Chieri, Conaway Joan, Canaway Ronald. Pol IIの一時停止および核体凝集体の制御におけるメディエーター複合体の役割, 第45回日本分子生物学会, Dec. 2022.
• 野口慶介, 鈴木秀文, 阿部竜太, 池陽子, 井野洋子, 木村弥生, 梁明秀, 土井宏, 田中章景, 山口雄輝, 高橋秀尚. 新規ビオチン標識法を用いたマルチオミクス解析によるCajal body構成因子の網羅的解析とCajal body形成メカニズムの解明, 第45回日本分子生物学会, Nov. 2022.
• 鈴木秀文, 阿部竜太, 嶋田美穂, 廣瀬智威, 廣瀬博子, 野口慶介, 池陽子, 安井七海, 古郡華月, 山口雄輝, 豊田敦, 鈴木穣, 山本達郎, 斉藤典子, Sato Shigeo, Tomomori-Sato Chieri, Conaway Ronald, Conaway Joan, 高橋秀尚. メディエーター複合体による新規の転写スピード調節機構の解明, 第45回日本分子生物学会, Nov. 2022.
• 山本淳一, 山口雄輝, 半田宏. ポマリドミド依存的な CRBN のネオ基質 ARID2 の解析, 第44回日本分子生物学会年会, Dec. 2021.
• 野口慶介, 鈴木秀文, 阿部竜太, 池陽子, 井野洋子, 木村弥生, 梁明秀, 土井宏, 田中章景, 山口雄輝, 高橋秀尚. 新規ビオチン標識法を用いたマルチオミックス解析によるCajal body形成メカニズムの解明, 第44回日本分子生物学会, Dec. 2021.
• 鈴木秀文, 阿部竜太, 嶋田美穂, 廣瀬智威, 廣瀬博子, 野口慶介, 古郡華月, 池陽子, 安井七海, 豊田敦, 鈴木穣, 山本達郎, 斉藤典子, Ronald Conaway, Joan Conaway, 山口雄輝, 高橋秀尚. メディエーター複合体による新規の3' Pol IIポージング制御機構の解明, 第44回日本分子生物学会, Dec. 2021.
• 奥田昌彦, 諏訪哲史, 鈴木秀文, 山口雄輝, 西村善文. RNAポリメラーゼと基本転写/修復因子TFIIHの新たな相互作用, 第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会, Dec. 2021.
• 諏訪哲史, 奥田昌彦, 鈴木秀文, 西村善文, 山口雄輝. 共通サブユニットRPB6を介したヒトRNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHの相互作用, 第44回日本分子生物学会, Dec. 2021.
• 原口大和, 坂本聡, 山口雄輝. ナノ磁性ビーズ精製とCRISPRライブラリースクリーニングによる薬剤標的分子の網羅的同定を目指した研究, 第44回日本分子生物学会, Dec. 2021.
• 古屋智基, 山口雄輝. In situ ビオチン化によるコヒーシン近傍因子の探索, 第44回日本分子生物学会, Dec. 2021.
• 山本淳一, 山口雄輝, 半田宏. ポマリドミド依存的なCRBNのネオ基質ARID2の解析, 第44回日本分子生物学会, Dec. 2021.
• 山口雄輝. RNAポリメラーゼとTFIIHの相互作用部位の細胞機能解析, BINDS-NMR報告会, Nov. 2021.
• 高橋秀尚, Amol Ranjan, 鈴木 秀文, 阿部 竜太, 廣瀬 智威, 佐々木 和教, 山口 雄輝, 中山 敬一, Joan Conaway, Ronald Conaway, 畠山 鎮次. メディエーター複合体による転写終結制御機構の解明, 第４２回日本分子生物学会年会, Dec. 2019.
• 高森 朝浩, Fajar Muhamad, 山口 雄輝. タンパク質コード遺伝子の3'末端プロセシングにおけるポリ(A)付加サイト選択の作用機序の解明, 第３７回染色体ワークショップ・第１８回核ダイナミクス研究会, Dec. 2019.
• 山口 雄輝, 瑞慶覧 安里, Muhamad Fajar, 舘野 峻平, 高森 朝浩. Pol IIの転写終結部位を制御する分子機構, 第４２回日本分子生物学会年会, Dec. 2019.
• 山口 雄輝. E3ユビキチンリガーゼを標的とした創薬の新展開, 東工大創薬ゲノムシンポジウム, Nov. 2019.
• 小泉 純玲, 坂本 聡, 山口 雄輝. 抗がん作用を有するカンナビノイドの作用機序の解析, 日本薬学会第139年会, Feb. 2019.
• 諏訪 哲史, 鈴木 秀文, 奥田 昌彦, 西村 善文, 山口 雄輝. TFIIH の多機能性を司るPleckstrin homology ドメインと新規標的因子の機能構造解析, 第４１回日本分子生物学会年会, Nov. 2018.
• 水止 洋孝, 新垣 貴之, 山口 雄輝. In situでのビオチン化反応を利用したタンパク質間相互作用の解析, 第４１回日本分子生物学会年会, Nov. 2018.
• Yuki Yamaguchi. Molecular mechanisms controlling pathways and sites for Pol Ⅱ transcription termination, 第４１回日本分子生物学会年会, Nov. 2018.
• 鈴木 秀文, 前田 亮, 木村 宏, 浦 聖恵, 田村 隆明, 山口 雄輝. DNA損傷応答における転写抑制メカニズムとその生理的意義の解析, ２０１７年度生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017.
• 舘野 峻平, Thiengtrong Benjarat, 山口 雄輝. snRNAプロセシング因子Integrator複合体の分子構造解析, ２０１７年度生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017.
• 山本 淳一, Fajar Muhamad, 瑞慶覧 安里, 舘野 峻平, 半田宏, 山口 雄輝. NELFを中心としたポリ(A)付加部位の選択機構の解析, ２０１７年度生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017.
• Fajar Muhamad, Ari Zukeran, Shunpei Tateno, Junichi Yamamoto, Hiroshi Handa, Yuki Yamaguchi. Mechanisms that affect post-transcriptional fate of RNA polymerase II-transcribed genes, ２０１７年度生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017.
• 鈴木 翔子, 柴田 紘孝, 山口 雄輝. マウスES細胞における2細胞期特異的遺伝子Zscan4の転写制御機構の解明, ２０１７年度生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017.
• 高橋 秀尚, 柴田 美音, 瀧川 一学, 渡部 昌, 築山 忠維, 山本 淳一, 山口 雄輝, 藤井聡, 飯田緑, Amol Ranjan, Shigeo Sato, Chieri Tomomori-Sato, Joan Conaway, Ronald Conaway, 畠山 鎮次. メディエーター複合体による転写終結制御機構, ２０１７年度生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017.
• 坂本 聡, Gupta Vipul, 劉 舒捷, 安藤秀樹, 舘野峻平, 金子裕生, 湯上真人, 石井亮平, 濡木 理, 山口雄輝, 半田 宏. 抗炎症薬サリチル酸が示す生体内作用メカニズムの解析, 日本化学会年第97春季年会, Mar. 2017.
• 瑞慶覧 安里, 舘野 峻平, 山本淳一, 山口 雄輝. ＲＮＡポリメラーゼⅡ転写産物の長さを決める３’末端プロセシングの制御メカニズムの解明, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2017, Jan. 2017.
• 徳山 遥香, 片山 美樹, 山口 雄輝. E3ユビキチンリガーゼCRBNの細胞内局在が免疫調整薬IMiDsの薬効に及ぼす影響, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2017, Jan. 2017.
• 坂本 聡, 山口 雄輝, 半田宏. ターゲット因子の解析を基盤とする生物活性物質が示す作用機構の解明, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2017, Jan. 2017.
• 鈴木秀文, 前田 亮, 木村 宏, 浦聖恵, 山口 雄輝, 田村隆明. DNA損傷時に誘導される転写制御の生理的意義とTLPの役割, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2017, Jan. 2017.
• 鈴木 翔子, 柴田 紘孝, 山口 雄輝. マウスES細胞における2細胞期特異的な遺伝子の発現制御メカニズムの解析, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2017, Jan. 2017.
• 舘野 峻平, 飯田 緑, 藤井 聡, 佐倉 絵里, 山口 雄輝. 多発性骨髄腫における Pomalidomide 標的因子の網羅的探索, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2017, Jan. 2017.
• 瑞慶覧 安里, 山本 淳一, 山口 雄輝. How Pol II termination and 3' processing sites are precisely determined in higher eukaryotes.高等真核生物においてPol IIの転写終結と3'プロセシングの部位はいかにして正確に決定されるのか, 第39回日本分子生物学会年会, Nov. 2016.
• 瑞慶覧 安里, 山本 淳一, 山口 雄輝. NELFを中心としたポリ(A)付加部位選択のメカニズム, 第39回日本分子生物学会年会, Nov. 2016.
• 瑞慶覧 安里, 舘野 峻平, 山本淳一, 山口 雄輝. NELFを中心としたポリ(A)付加部位選択のメカニズム, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2016, Sept. 2016.
• 鈴木秀文, 前田 亮, 浦聖恵, 木村 宏, 山口 雄輝, 田村隆明. ＴＢＰ類似因子ＴＬＰによるＤＮＡ損傷応答時の転写抑制と細胞死誘導機構の解析, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2016, Sept. 2016.
• 瑞慶覧 安里, 長谷川 冴妃子, 舘野 峻平, 山本淳一, 山口 雄輝. 高等真核生物においてPOL Ⅱの転写終結と3'プロセシングの部位はいかにして正確に決定されるのか, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2016, Sept. 2016.
• 伊藤 拓水, 朝妻 知子, 山本 淳一, 安藤 秀樹, 佐藤 智美, 山口 雄輝, 半田 宏. リガンド依存的ユビキチンリガーゼＣＲＢＮの制御機構, 日本ケミカルバイオロジー学会第11回年会, June 2016.
• 坂本 聡, 伊藤 拓水, 森 智行, 安藤 秀樹, 山口 雄輝, 箱嶋 敏雄, 半田 宏. CRBNに対するサリドマイド光学異性体の結合基盤解析, 日本ケミカルバイオロジー学会第11回年会, June 2016.
• 舘野 峻平, 飯田緑, 藤井聡, 山口 雄輝. 多発性骨髄腫におけるPomalidomide標的因子の網羅的探索, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 新垣 貴之, 徳山 遥香, 山口 雄輝. PolⅡ複合体をモデルとしたタンパク質間相互作用の実験系の評価, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 瑞慶覧 安里, 山本 淳一, 磯部 智康, 山口 雄輝. NELFを中心としたRNAの品質管理のメカニズム, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 徳山 遥香, 新垣 貴之, 山口雄輝. サリドマイド標的タンパク質CRBNの相互作用因子の探索, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 鈴木 翔子, 柴田 紘孝, 山口 雄輝. マウスES細胞における2細胞期特異的な遺伝子の発現制御メカニズムの解析, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 山口 雄輝, 伊藤拓水, 山本淳一, 半田宏. サリドマイドの多様な薬理作用の分子メカニズム, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 外山 黛, 荻原 裕里, Thiengtrong Benjarat, 山口 雄輝. snRNA3'末端プロセシング因子インテグレーターの構造・機能解析, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 佐倉 絵里, 舘野 峻平, 山口 雄輝. 新規抗がん剤の作用機構の解明, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2016, Feb. 2016.
• 舘野 峻平, 飯田緑, 藤井聡, 山口 雄輝. 多発性骨髄腫に対するポマリドマイドの標的因子の網羅的探索, 第３８回日本分子生物学会年会, Dec. 2015.
• 山口雄輝. ＰｏｌⅡの転写伸長と運命決定制御のメカニズム, 第２回北陸エピジェネティクス研究会, Nov. 2015.
• 山口 雄輝, 磯部智康, 曹 青福, 山本 淳一. 転写伸長段階の制御メカニズム：新たな制御因子の探索, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2015, Aug. 2015.
• 磯部智康, 山口 雄輝. 転写伸張因子DSIFのCTRを介した転写制御機構の解析, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2015, Aug. 2015.
• 瑞慶覧 安里, 山本 淳一, 磯部智康, 山口 雄輝. NELFを中心としたmRNAの品質管理のメカニズム, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2015, Aug. 2015.
• 坂本 聡, 伊藤 拓水, 安藤 秀樹, 山口 雄輝, 半田 宏. IMiDs標的タンパク質CRBNの生化学的解析, 日本ケミカルバイオロジー学会第１０回年会, June 2015.
• 坂本 聡, 山口雄輝, 半田 宏. アフィニティビーズを利用した生物活性物質標的タンパク質の単離・同定・評価, 日本薬学会第135年会, Mar. 2015.
• 磯部智康, 千葉 国俊, 山口 雄輝. 転写伸長因子DSIFのリン酸化の転写伸長反応への寄与の解析, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2015, Feb. 2015.
• 山本淳一, 半田宏, 山口 雄輝. DSIF and NELF interact with Integrator to specify the correct post-transcriptional fate of snRNA genes, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2015, Feb. 2015.
• Yuki Yamaguchi, Junichi Yamamoto. Regulatory Mechanisms for Pol II Termination Sites and 3' Processing Pathways in Higher Eukaryotes, 新学術領域研究「転写サイクル」国際シンポジウム2014, Nov. 2014.
• 片山 美樹, 伊藤拓水, 安藤 秀樹, 山口 雄輝, 半田宏. E3ユビキチンリガーゼの基質認識レセプター CRBNとポマリドマイド依存的な基質Aiolosの生化学的解析, 第３７回日本分子生物学会年会, Nov. 2014.
• 曹 青福, 陳 業熹, 半田 宏, 山口 雄輝. 新規転写伸長因子ヒトRtf1が関与する転写制御の分子機構, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2014, Aug. 2014.
• 山口雄輝, 山本淳一, 半田宏. ヒトRNA ポリメラーゼII 転写産物のプロセシング経路の選択機構, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2014, Aug. 2014.
• 磯部智康, 千葉 国俊, 山口 雄輝. 転写伸長因子DSIFにリン酸化依存的に相互作用する因子の機能解析, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2014, Aug. 2014.
• 山本淳一, 半田宏, 山口雄輝. DSIF and NELF interact with Integrator to specify the correct post-transcriptional fate of snRNA genes, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2014, Aug. 2014.
• 柴田 紘孝, 半田宏, 山口 雄輝. 転写伸長因子DSIFおよびNELFがES細胞の多分化能維持に果たす役割, 新学術領域研究「転写サイクル」班会議2014, Aug. 2014.
• 坂本 聡, Vipul Gupta, 劉 舒捷, 安藤 秀樹, 舘野 峻平, 金子 裕生, 湯上 真人, 石井 亮平, 濡木 理, 山口 雄輝, 半田 宏. 抗炎症薬サリチル酸の生体内作用機構の解析, 日本ケミカルバイオロジー学会第９回年会, June 2014.
• 坂本 聡, 唐澤 慧記, 東 基記, 笠間 健嗣, 宮澤 啓介, 山口 雄輝, 半田 宏. ビタミンK2が引き起こすがん細胞のアポトーシス誘導機構の解析, 日本化学会第９４春季年会, Mar. 2014.
• 中村 佳奈子, 山口 雄輝. ゲノム上のRNAポリメラーゼ等の動的解析を目指した予備的な検討, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2014, Jan. 2014.
• 飯田緑, 舘野 峻平, 山口 雄輝, 藤井聡. Cellecta社製プール型レンチウイルスshRNAライブラリーを用いたスクリーニングデータ解析法の検討, 新学術領域「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2014, Jan. 2014.
• 柴田 紘孝, 半田 宏, 山口 雄輝. 転写伸長因子DSIFおよびNELFがES細胞の多分化能維持に果たす役割, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2014, Jan. 2014.
• 曹 青福, 陳 業熹, 半田 宏, 山口 雄輝. 転写伸長因子ヒトPaf1複合体が関与する転写制御の分子機構, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2014, Jan. 2014.
• 舘野 峻平, 山口 雄輝. 多発性骨髄腫に対するポマリドマイドの標的因子の網羅的探索, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2014, Jan. 2014.
• 長谷川 冴妃子, 千葉 国俊, 磯部智康, 山口 雄輝. 転写伸長因子DSIFにリン酸化依存的に相互作用する因子の機能解析, 新学術領域研究「転写サイクル」冬の若手ワークショップ2014, Jan. 2014.
• 中村 佳奈子, 山口 雄輝. ゲノム上のRNA ポリメラーゼ等のカイネティクス解析を目指した予備的な検討, 第３６回日本分子生物学会年会, Dec. 2013.
• 舩造 正英, 伊藤 拓水, 安藤 秀樹, 山口 雄輝, 半田 宏. 多発性骨髄腫におけるCRBN 結合因子の探索及び解析, 第３６回日本分子生物学会年会, Dec. 2013.
• 舘野 峻平, 山口 雄輝. 多発性骨髄腫に対するポマリドマイドの標的因子の網羅的探索, 第３６回日本分子生物学会年会, Dec. 2013.
• 飯田 結, 伊藤 拓水, 安藤 秀樹, 山口 雄輝, 半田 宏. サリドマイドターゲット分子CRBN の生化学的解析, 第３６回日本分子生物学会年会, Dec. 2013.
• 伊藤 拓水, 安藤 秀樹, 山口雄輝, 半田 宏. S16-4 サリドマイドによる催奇性の分子機構 : ナノビーズ技術を用いたアプローチ(シンポジウムS16 薬物有害反応の発現機構と予測の新展開,臨床から学び臨床へと還元する医療薬学), 日本医療薬学会年会講演要旨集, 日本医療薬学会, Vol. 20, pp. 236, Oct. 2010.

その他の論文・著書など

• Junichi Yamamoto, Takumi Ito, Yuki Yamaguchi, Hiroshi Handa. Discovery of CRBN as a target of thalidomide: a breakthrough for progress in the development of protein degraders., CHEM. SOC. REV., 51, 6234-6250, July 2022.
• Takumi Ito, Yuki Yamaguchi, Hiroshi Handa. Exploiting ubiquitin ligase cereblon as a target for small-molecule compounds in medicine and chemical biology, Cell Chem. Biol., 28, 7, 987-999, July 2021.
• 山口 雄輝. サリドマイド胎芽症診療ガイド 2020, サリドマイド胎芽症診療ガイド 2020, 国立国際医療研究センター, May 2020.
• 山口雄輝. 転写伸長研究の新展開, 生化學, 日本生化学会, Vol. 82, No. 3, pp. 210-220, Mar. 2010.
• Nedialkov, Y.A., Gong, X.Q., Yamaguchi, Y., Handa, H., Burton, Z.F.. Assay of transient state kinetics of elongation by human RNA polymerase II, Methods in Enzymol., Vol. 371, pp. 252-264, 2003.
• Yamaguchi, Y., Delehouzee, S., Handa, H.. HIV and HDV: evolution takes different paths to relieve blocks in transcriptional elongation, Microbes Infect., Vol. 4, pp. 1169-1175, 2002.
• Kim, D., Yamaguchi Y., Wada, T., Handa, H.. The regulation of elongation by eukaryotic RNA polymerase II: A recent view., Mol. Cells, Vol. 11, pp. 267-274, 2001.
• Yamaguchi, Y., Narita, T., Inukai, N., Wada, T., Handa, H.. SPT genes: Key players in the regulation of transcription, chromatin structure and other cellular processes, J. Biochem., Vol. 129, pp. 185-191, 2001.
• Yamaguchi, Y., Wada, T., Handa, H.. Interplay between positive and negative elongation factors: drawing a new view of DRB, Genes Cells, Vol. 3, pp. 9-15, 1998.

特許など

• 山口雄輝, 山本淳一, 半田　宏　, 伊藤　拓水　. 抗骨髄腫剤および抗骨髄腫剤のスクリーニング方法. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学, 学校法人東京医科大学. 2020/08/25. 特願2020-141689. 2022/03/09. 特開2022-037510. 2022.
• 山口雄輝, 半田　宏　, 伊藤　拓水, 朝妻　知子, Luisa Guerrini. p63スプライシングバリアントの分解剤およびその用途. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学, 学校法人東京医科大学, ミラノ大学. 2019/07/30. 特願2019-139820. 2021/02/18. 特開2021-020879. 2021.
• 山口雄輝, 舘野峻平, 片山　美樹, 半田　宏　. ＣＲＢＮモジュレーターの薬効を高める補助薬のスクリーニング方法. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学, 学校法人東京医科大学. 2018/05/15. 特願2018-093652. 2019/11/21. 特開2019-198254. 2019.
• 今井剛, 半田宏, 山口雄輝. 骨、関節又は歯異常症の治療物質のスクリーニング方法. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学. 2012/06/22. 特願2012-140671. 2013/09/26. 特開2013-188201. 2013.
• 今井剛, 半田宏, 山口雄輝. 相乗的抗糖尿病治療剤. 特許. 登録. 国立大学法人東京工業大学. 2012/05/10. 特願2012-108729. 2013/11/21. 特開2013-234159. 特許第6015903号. 2016/10/07 2016.

学位論文

• 転写伸長反応を抑制する因子群の同定と解析,  本文,  博士（工学）,  東京工業大学,  1999/03/26,   
• 転写伸長反応を抑制する因子群の同定と解析,  本文,  博士（工学）,  東京工業大学,  1999/03/26, 

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