論文

• Yanagisawa K, Komine S, Kubota R, Ohue M, Akiyama Y.. Optimization of memory use of fragment extension-based protein–ligand docking with an original fast minimum cost flow algorithm, Computational Biology and Chemistry (In Proc. APBC2018), Volume 74, Page 399-406, June 2018.  公式リンク  
  
• Yanagisawa K, Komine S, Shogo Suzuki, Ohue M, Ishida T, Akiyama Y.. Spresso: an ultrafast compound pre-screening method based on compound decomposition, Bioinformatics, OXFORD Academic, Volume 33, Issue 23, Page 3836-3843, Mar. 2017.  公式リンク  
  

国際会議発表 (査読有り)

• Keisuke Yanagisawa, Shunta Komine, Shogo Suzuki, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. ESPRESSO: An ultrafast compound pre-screening method based on compound decomposition, The 27th International Conference on Genome Informatics (GIW 2016), Oct. 2016.

国際会議発表 (査読なし・不明)

• Keisuke Yanagisawa, Shunta Komine, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. Fast pre-filtering for virtual screening based on compound fragmentation, 3nd IIT Madras – Tokyo Tech Joint Symposium on Algorithms and Applications of Bioinformatics, Nov. 2015.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 柳澤渓甫, 小峰駿汰, 久保田陸人, 大上雅史, 秋山泰. フラグメント伸長型化合物ドッキング計算のための重み付きオフラインキャッシュ問題の厳密解アルゴリズム, 情報処理学会 第50回バイオ情報学研究会, 研究報告バイオ情報学（BIO）, 情報処理学会, 2017-BIO-50, 38, 1-8, June 2017.  公式リンク  
  
• Keisuke Yanagisawa, Shunta Komine, Shogo Suzuki, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. ESPRESSO: An ultrafast compound pre-screening method with segmented compounds, Chem-Bio Informatics Society(CBI) Annual Meeting 2016, Oct. 2016.
• Keisuke Yanagisawa, Shunta Komine, Shogo Suzuki, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. ESPRESSO: An ultrafast compound pre-screening method based on compound segmentation, Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2016 (IIBMP2016), Sept. 2016.
• 柳澤 渓甫, 小峰 駿汰, 鈴木 翔吾, 大上 雅史, 石田 貴士, 秋山 泰. フラグメント分割に基づく超高速化合物プレスクリーニング手法ESPRESSO, 情報処理学会 第46回バイオ情報学研究会, 研究報告バイオ情報学（BIO）, 情報処理学会, 2016-BIO-46, 18, 1-7, June 2016.  公式リンク  
  
• 柳澤 渓甫, 小峰 駿汰, 大上 雅史, 石田 貴士, 秋山 泰. Fast pre-filtering for virtual screening based on ligand decomposition, 第21回創剤フォーラム若手研究会, Nov. 2015.
• Keisuke Yanagisawa, Shunta Komine, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. Fast pre-filtering for virtual screening based on compound decomposition, IIBMP2015, Oct. 2015.
• 小峰駿汰, 石田貴士, 秋山泰. フラグメント伸長型タンパク質-化合物ドッキングのビームサーチによる高速化, 情報処理学会 第42回バイオ情報学研究会, 情報処理学会研究報告, 2015.

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