論文

• Basudev Maity, Mitsuo Shoji, Fangjia Luo, Takanori Nakane, Satoshi Abe, Shigeki Owada, Jungmin Kang, Kensuke Tono, Rie Tanaka, Thuc Toan Pham, Mariko Kojima, Yuki Hishikawa, Junko Tanaka, Jiaxin Tian, Misaki Nagama, Taiga Suzuki, Hiroki Noya, Yuto Nakasuji, Asuka Asanuma, Xinchen Yao, So Iwata, Yasuteru Shigeta, Eriko Nango Takafumi Ueno. Real-time observation of a metal complex-driven reaction intermediate using a porous protein crystal and serial femtosecond crystallography, Nature Communications, Volume 15, June 2024.
• Mariko Kojima, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Kunio Hirata, Xinchen Yao, Ayako Kobayashi, Ririko Kobayashi, Takafumi Ueno. High-throughput structure determination of an intrinsically disordered protein using cell-free protein crystallization, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 121, no. 25, pp. e2322452121, June 2024.
• Junko Tanaka, Satoshi Abe, Tohru Hayakawa, Mariko Kojima, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Takafumi Ueno. Crystal structure of the in-cell Cry1Aa purified from Bacillus thuringiensis, Biochemical and Biophysical Research Communications, Vol. 685, Issue 10, Page 149144, Oct. 2023.
• Mariko Kojima, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Yuki Hishikawa, Akio Kitao, Takafumi Ueno. Engineering of an in-cell protein crystal for fastening a metastable conformation of a target miniprotein, Biomater. Sci., vol. 11, no. 4, pp. 1350-1357, Feb. 2023.
• Abe Satoshi, Tanaka Junko, Kojima Mariko, Kanamaru Shuji, Hirata Kunio, Yamashita Keitaro, Kobayashi Ayako, Ueno Takafumi. Cell-free protein crystallization for nanocrystal structure determination, Scientific Reports, Oct. 2022.
• Mariko Kojima, Satoshi Abe, Takafumi Ueno. Engineering of protein crystals for use as solid biomaterials, Biomaterials Science, Vol. 10, Issue 2, p. 354-367, Dec. 2021.
• Que D. Nguyen, Kosuke Kikuchi, Mariko Kojima, Takafumi Ueno. Dynamic Behavior of Cargo Proteins Regulated by Linker Peptides on a Protein Needle Scaffold, Chemistry Letters, Oct. 2021.  公式リンク  
  
• Tien Khanh Nguyen, Satoshi Abe, Makoto Kasamatsu, Basudev Maity, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Mariko Kojima, Takafumi Ueno. In-Cell Engineering of Protein Crystals with Nanoporous Structures for Promoting Cascade Reactions, ACS Appl. Nano Mater., Jan. 2021.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 安部 聡, 小島摩利子, 中筋勇人, Xinchen Yao, 上野隆史. 無細胞タンパク質結晶化の迅速構造決定への応用, 第17回バイオ関連化学シンポジウム, Sept. 2023.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. 細胞内タンパク質結晶エンジニアリングによる天然変性タンパク質の構造決定, The 103nd CSJ Annual Meeting (2023), Mar. 2023.
• Yao Xinchen, Yuki Kojima, Satoshi Abe, Takafumi Ueno. Molecular design for immobilizing foreign molecules into porous protein crystals, The 103rd CSJ Annual Meeting, Mar. 2023.
• 安部 聡, 小島摩利子, 上野隆史. タンパク質結晶化を促進する細胞内鋳型結晶設計, 日本結晶学会年会, Nov. 2022.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. 細胞内タンパク質結晶を用いた天然変性タンパク質の網羅的構造解析, 第60回日本生物物理学会年会, Sept. 2022.
• Satoshi Abe, Junko Tanaka, Yuki Kojima, Takafumi Ueno. Protein crystallization and structure analysis using cell-free protein synthesis, 第60回日本生物物理学会年会, Sept. 2022.
• 安部 聡, 田中潤子, 小島摩利子, 上野隆史. 無細胞タンパク質結晶化を用いたナノ結晶構造解析, 第32回バイオ・高分子シンポジウム, July 2022.
• Mariko Kojima, Yuki Hishikawa, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao, Takafumi Ueno. Dynamics structural analysis of miniprotein by in-cell crystal engineering, The 102nd CSJ Annual Meeting (2022), Mar. 2022.
• Satoshi Abe, Mariko Kojima, Junko Tanaka, Yuto Nakasuji, Takafumi Ueno. In-cell crystal engineering for the development of solid biomaterials, The 102nd CSJ Annual Meeting (2022), Mar. 2022.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. 細胞内タンパク質結晶を利用した天然変性タンパク質の構造解析, 第15回バイオ関連化学シンポジウム2021, Sept. 2021.
• Mariko Kojima, Yuki Hishikawa, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao, Takafumi Ueno. Energy Analysis of Miniprotein by in Vivo Protein Crystallization, 日本化学会第101春季年会, Mar. 2021.
• 安部 聡, 小島摩利子, 上野隆史. タンパク質の迅速結晶化とサブミクロン結晶の構造解析, 第69回高分子討論会, Sept. 2020.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. 無細胞タンパク質合成による微小結晶構造解析, 第14回バイオ関連化学シンポジウム2020, Sept. 2020.
• Mariko Kojima, Satoshi Abe, Takafumi Ueno. In vivo Protein Crystal Engineering for Structure Analysis of Meta-stable State Mini-protein, 第69回高分子討論会, Sept. 2020.
• 安部 聡, 小島摩利子, 小暮遼河, 上野隆史. 細胞内タンパク質結晶化の最適化と迅速構造解析, 第14回バイオ関連シンポジウム, Sept. 2020.
• 安部 聡, 小島摩利子, 小暮遼河, 上野隆史. タンパク質の細胞内迅速・微量結晶化と構造解析, 第69回高分子学会年次大会, May 2020.
• 安部 聡, 小島摩利子, 小暮遼河, 上野隆史. タンパク質の迅速構造解析を目指した多角体の結晶化設計, 日本化学会 第100春季年会（2020）, Mar. 2020.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. ミニタンパク質融合多角体タンパク質の細胞内結晶化, 日本化学会第100春季年会, Mar. 2020.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. ミニタンパク質融合多角体タンパク質の結晶設計, 第13回バイオ関連化学シンポジウム, Sept. 2019.
• 安部 聡, 小島摩利子, 上野隆史. 多角体タンパク質の結晶化設計, 第13回バイオ関連化学シンポジウム, Sept. 2019.
• Mariko Kojima, Satoshi Abe, Takafumi Ueno. In vivo crystallization of polyhedra protein fused with metal binding peptide”, 第68回高分子学会年次大会, May 2019.
• Mariko Kojima. In vivo crystallization of fusion proteins using polyhedra crystals, 第68回高分子学会年次大会, May 2019.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. 多角体形成反応を利用したペプチド融合タンパク質の細胞内結晶化, 日本化学会第99春季年会, Mar. 2019.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. 多角体融合タンパク質の細胞内結晶化, 第8回CSJ化学フェスタ2018, Oct. 2018.
• 小島摩利子, 安部聡, 上野隆史. 多角体を利用した融合タンパク質の細胞内結晶化, 第67回高分子学会年次大会, May 2018.

特許など

• 上野隆史, 安部聡, 小島摩利子, 田中潤子. タンパク質結晶材料の製造. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学. 2022/12/06. PCT/JP2022/044913. 2023/06/15. WO 2023/106291. 2023.
• 上野隆史, 安部聡, 小島摩利子, 田中潤子. タンパク質結晶材料の製造. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学. 2021/12/07. 特願2021-198864. 2025/02/05. 特開2025-016809. 2025.
• 上野隆史, 安部聡, 小島摩利子. タンパク質固体材料の製造. 特許. 公開. 国立大学法人東京工業大学. 2020/08/06. PCT/JP2020/030226. 2021/02/11. WO 2021/025126. 2021.
• 上野隆史, 安部聡, 小島摩利子. タンパク質固体材料の製造. 特許. 登録. 国立大学法人東京科学大学, 株式会社セルフリーサイエンス. 2020/08/06. 特願2021-537385. 2021/02/11. WO 2021/025126. 特許第7578960号. 2024/10/29 2024.

学位論文

• In-cell protein crystal engineering for nanocrystal structure determination,  Thesis,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2023/06/30, 
• In-cell protein crystal engineering for nanocrystal structure determination,  Exam Summary,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2023/06/30,   
• In-cell protein crystal engineering for nanocrystal structure determination,  Summary,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2023/06/30,   
• In-cell protein crystal engineering for nanocrystal structure determination,  Outline,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2023/06/30,   

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