論文

• Dai Yoshimura, Rei Kajitani, Yasuhiro Gotoh, Katsuyuki Katahira, Miki Okuno, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Takehiko Itoh. Evaluation of SNP calling methods for closely related bacterial isolates and a novel high-accuracy pipeline: BactSNP, Microbial Genomics, e000261, May 2019.
• Osamu Sawada, Yasuhiro Gotoh, Takako Taniguchi, Shota Furukawa, Dai Yoshimura, Satomi Sasaki, Haruki Shida, Yoshihiro Kusunoki, Tsuyoshi Yamamura, Ken Furuya, Takehiko Itoh, Tetsuya Horita, Tetsuya Hayashi, Naoaki Misawa. Genome Sequencing Verifies Relapsed Infection of Helicobacter cinaedi, Open Forum Infectious Diseases, Vol. 6, No. 5, Apr. 2019.
• Rei Kajitani, Dai Yoshimura, Miki Okuno, Yohei Minakuchi, Hiroshi Kagoshima, Asao Fujiyama, Kaoru Kubokawa, Yuji Kohara, Atsushi Toyoda, Takehiko Itoh. Platanus-allee is a de novo haplotype assembler enabling a comprehensive access to divergent heterozygous regions, Nature Communications, 1702, Apr. 2019.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 服部 淳, 伊藤 武彦, 吉村 大. Comprehensive detection of insertion sequences in bacterial genomes, 第8回生命医薬情報学連合大会, Sept. 2019.

学位論文

• 高精度ゲノム解析手法の確立による大腸菌O157の大規模比較研究,  要約,  博士(理学),  東京工業大学,  2019/06/30,   
• 高精度ゲノム解析手法の確立による大腸菌O157の大規模比較研究,  論文要旨,  博士(理学),  東京工業大学,  2019/06/30,   
• 高精度ゲノム解析手法の確立による大腸菌O157の大規模比較研究,  審査の要旨,  博士(理学),  東京工業大学,  2019/06/30,   
• 高精度ゲノム解析手法の確立による大腸菌O157の大規模比較研究,  本文,  博士(理学),  東京工業大学,  2019/06/30, 

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