論文

• Keisuke Yanagisawa, Rikuto Kubota, Yasushi Yoshikawa, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Effective Protein-Ligand Docking Strategy via Fragment Reuse and a Proof-of-Concept Implementation, ACS Omega, American Chemical Society, Volume 7, Issue 34, pp. 30265-30274, Aug. 2022.  公式リンク  
  
• Yanagisawa K, Komine S, Kubota R, Ohue M, Akiyama Y.. Optimization of memory use of fragment extension-based protein–ligand docking with an original fast minimum cost flow algorithm, Computational Biology and Chemistry (In Proc. APBC2018), Volume 74, Page 399-406, June 2018.  公式リンク  
  

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 久保田陸人, 柳澤渓甫, 吉川寧, 大上雅史, 秋山泰. 共通な部分構造の再利用による高速なタンパク質リガンドドッキング手法の開発, 情報処理学会研究報告, Vol. 2020-BIO-61, No. 4, pp. 1-8, Mar. 2020.  公式リンク  
  
• 久保田陸人, 柳澤渓甫, 大上雅史, 秋山泰. 共通な部分構造の再利用アルゴリズムを用いたタンパク質リガンドドッキング手法の開発, 情報処理学会研究報告 バイオ情報学（BIO）, 研究報告バイオ情報学（BIO）, 情報処理学会, 2018-BIO-54(42), 1-8, June 2018.
• 柳澤渓甫, 小峰駿汰, 久保田陸人, 大上雅史, 秋山泰. フラグメント伸長型化合物ドッキング計算のための重み付きオフラインキャッシュ問題の厳密解アルゴリズム, 情報処理学会 第50回バイオ情報学研究会, 研究報告バイオ情報学（BIO）, 情報処理学会, 2017-BIO-50, 38, 1-8, June 2017.  公式リンク  
  

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