|
秋山泰 2012年 研究業績一覧 (24件 / 574件)
論文
国際会議発表 (査読有り)
-
Masahito Ohue,
Yuri Matsuzaki,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
Improvement of the protein-protein docking prediction by introducing a simple hydrophobic interaction model: an application to interaction pathway analysis.,
The 7th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB2012),
Lecture Notes in Bioinformatics,
Springer Heidelberg,
Vol. 7632,
Page 178-187,
Nov. 2012.
公式リンク
-
Y. Namiki,
T. Ishida,
Y. Akiyama.
Fast DNA Sequence Clustering Based on Longest Common Subsequence,
ICIC2012,
Communications in Computer and Information Science,
No. 304,
pp. 453-460,
June 2012.
-
Suzuki, S.,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
An ultra-fast computing pipeline for metagenome analysis with next-generation DNA sequencers,
Proceedings - 2012 SC Companion: High Performance Computing, Networking Storage and Analysis, SCC 2012,
pp. 1549-1551,
2012.
国際会議発表 (査読なし・不明)
-
Masahito Ohue,
Yuri Matsuzaki,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
MEGADOCK: A rapid screening system of protein-protein interactions with all-to-all physical docking.,
International Society for Computational Biology, ISCB-Asia 2012,
Dec. 2012.
-
Yuri Matsuzaki,
Masahito Ohue,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
Application of exhaustive protein-protein interaction prediction system by using protein docking to signal transduction pathways.,
International Society for Computational Biology, ISCB-Asia 2012,
Dec. 2012.
-
Yuri Matsuzaki,
Masahito Ohue,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
Application of exhaustive protein-protein interaction prediction system by using protein docking to signal transduction pathways.,
3DSIG: The 8th structural bioinformatics and computational biophysics meeting,
July 2012.
-
Yuri Matsuzaki,
Masahito Ohue,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
Application of exhaustive protein-protein interaction prediction system by using protein docking to signal transduction pathways.,
20th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2012),
July 2012.
-
Masahito Ohue,
Yuri Matsuzaki,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
MEGADOCK: A rapid screening system of protein-protein interactions with all-to-all physical docking.,
20th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2012),
July 2012.
-
Masahito Ohue,
Yuri Matsuzaki,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
MEGADOCK: A rapid screening system of protein-protein interactions with all-to-all physical docking.,
3DSIG: The 8th structural bioinformatics and computational biophysics meeting,
July 2012.
-
Masahito Ohue,
Yuri Matsuzaki,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
Protein Complex Structure Prediction with Normal Mode Ensemble and Physical Docking,
Bioinformatics week in Odaiba 2011 (BiWO2011),
Bioinformatics week in Odaiba 2011 (BiWO2011),
P-01,
Jan. 2012.
-
N. Uchikoga,
T. Hirokawa,
Y. Akiyama.
Post-docking process by using representative interaction fingerprints,
Bioinformatics week in Odaiba 2011 (BiWO2011),
Jan. 2012.
-
Masahito Ohue,
Yuri Matsuzaki,
Nobuyuki Uchikoga,
Takashi Ishida,
Yutaka Akiyama.
Bound state structure estimation of protein-protein complex using rigid-body protein-protein docking method,
The 10th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2012),
The 10th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2012),
P-50,
Jan. 2012.
国内会議発表 (査読なし・不明)
-
山本航平,
大上雅史,
石田貴士,
秋山泰.
構造情報に基づくタンパク質間相互作用ネットワーク予測精度の改善,
第32回バイオ情報学研究会,
研究報告バイオ情報学(BIO),
情報処理学会,
vol. 2012-BIO-32,
no. 14,
pp. 1-7,
Nov. 2012.
公式リンク
-
大上雅史,
松崎由理,
石田貴士,
秋山泰.
MEGADOCKを用いたタンパク質間相互作用予測のヒトアポトーシスパスウェイ解析への応用,
第32回バイオ情報学研究会,
研究報告バイオ情報学(BIO),
情報処理学会,
Vol. 2012-BIO-32,
No. 13,
pp. 1-8,
Nov. 2012.
公式リンク
-
秋山 泰.
世界最深度のメタゲノム解析を可能にする超並列パイプラインの開発,
サイエンティフィック・システム研究会 合同分科会 2012年度会合,
Oct. 2012.
-
藤原 隆之,
松崎由理,
石田貴士,
秋山泰.
タンパク質間ドッキング予測における目的関数の機械学習を用いた動的調整,
電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング,
一般社団法人電子情報通信学会,
Vol. 112,
No. 108,
pp. 101-103,
June 2012.
-
杉浦典和,
石田貴士,
関嶋政和,
秋山泰.
ハッシュテーブルの分割によるde novoアセンブリの改良,
情報処理学会第29回バイオ情報学研究発表会,
情報処理学会研究報告,
情報処理学会,
2012-BIO-29,
June 2012.
-
藤原隆之,
松崎由理,
石田貴士,
秋山泰.
タンパク質間ドッキング予測における機械学習を用いた目的関数の動的調整,
第29回バイオ情報学研究会,
情報処理学会研究報告,
Vol. 2012-BIO-29,
No. 19,
pp. 1-3,
June 2012.
-
大上雅史,
石田貴士,
秋山泰.
簡易疎水性相互作用モデルによるタンパク質間ドッキング予測の高精度化,
第29回バイオ情報学研究会,
研究報告バイオ情報学(BIO),
情報処理学会,
vol. 2012-BIO-29,
no. 21,
p. 1-3,
June 2012.
公式リンク
-
下田雄大,
石田貴士,
秋山泰.
タンパク質間ドッキング予測における実空間での効率的な評価スコア計算方法の研究,
情報処理学会研究報告,
第29回バイオ情報学研究会,
vol. 2012-BIO-29,
no. 20,
p. 1-3,
June 2012.
-
鈴木脩司,
石田貴士,
秋山 泰.
Suffix arrayを用いた高速な配列相同性検索の改良とエピゲノム解析への対応,
第29回バイオ情報学研究会,
情報処理学会研究報告,
Vol. 2012-BIO-29,
No. 24,
pp. 1-7,
June 2012.
-
松崎 由理,
内古閑 伸之,
大上 雅史,
秋山 泰.
網羅的タンパク質ドッキング解析プログラムMEGADOCKの開発と応用,
文部科学省「革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ(HPCI)の構築」(※1) 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発(ナノ)(※2) 次世代生命体統合シミュレーションソフトウェアの研究開発(ライフ) 公開シンポジウム,
Mar. 2012.
-
秋山泰.
スーパーコンピュータが解き明かす生命の不思議,
京速コンピュータ「京」を知る集い,
Jan. 2012.
[ BibTeX 形式で保存 ]
[ 論文・著書をCSV形式で保存
]
[ 特許をCSV形式で保存
]
|